Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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ERCC8Q13216 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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ERCC8Q13216 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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ERCC8Q13216 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ERCC8Q13216 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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ERCC8Q13216 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERCC8Q13216 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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