Protein–RNA interactions for Protein: Q13162

PRDX4, Peroxiredoxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX4Q13162 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRDX4Q13162 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRDX4Q13162 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms