Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GPS1Q13098 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPS1Q13098 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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