Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIK3Q13003 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRIK3Q13003 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIK3Q13003 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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