Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BNIP3Q12983 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BNIP3Q12983 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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