Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPN13Q12923 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PTPN13Q12923 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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