Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFSWAPQ12872 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFSWAPQ12872 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
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