Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TWF1Q12792 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWF1Q12792 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWF1Q12792 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWF1Q12792 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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