Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 PPE1YHR075C 1203 nt5.45□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 AIM23YJL131C 1071 nt5.45□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 SFK1YKL051W 1062 nt5.45□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 HRT3YLR097C 1035 nt5.45□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 SRB6YBR253W 366 nt5.45□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 PMT5YDL093W 2232 nt5.45□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 SAS10YDL153C 1833 nt5.45□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 PUT1YLR142W 1431 nt5.45□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 LDB17YDL146W 1476 nt5.45□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 TRS23YDR246W 660 nt5.44□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YDR282CYDR282C 1245 nt5.44□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 DSD1YGL196W 1287 nt5.44□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YMR245WYMR245W 621 nt5.44□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YNL134CYNL134C 1131 nt5.44□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 MDG1YNL173C 1101 nt5.44□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YOL162WYOL162W 648 nt5.44□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 MET31YPL038W 534 nt5.44□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 TGL4YKR089C 2733 nt5.44□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 PDR10YOR328W 4695 nt5.44□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 ROT2YBR229C 2865 nt5.43□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 MGS1YNL218W 1764 nt5.43□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 PTC1YDL006W 846 nt5.43□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 AIR2YDL175C 1035 nt5.43□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 UBC1YDR177W 648 nt5.43□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 POP6YGR030C 477 nt5.43□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YHR054CYHR054C 1065 nt5.43□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 DCD1YHR144C 939 nt5.43□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YIF1YNL263C 945 nt5.43□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 NUR1YDL089W 1455 nt5.43□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 RAD16YBR114W 2373 nt5.43□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 ATM1YMR301C 2073 nt5.43□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 PTM1YKL039W 1572 nt5.42□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 BLM10YFL007W 6432 nt5.42□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 TMN2YDR107C 2019 nt5.42□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 snR63snR63 255 nt5.42□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 SLC1YDL052C 912 nt5.42□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 SHR3YDL212W 633 nt5.42□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 RRP17YDR412W 708 nt5.42□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt5.42□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 HPM1YIL110W 1134 nt5.42□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 SUI2YJR007W 915 nt5.42□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YLR326WYLR326W 723 nt5.42□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 PHO90YJL198W 2646 nt5.42□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 TPO2YGR138C 1845 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 HRK1YOR267C 2280 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 GAS2YLR343W 1668 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YHL012WYHL012W 1482 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 MRPL7YDR237W 879 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 GEP7YGL057C 864 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YHB1YGR234W 1200 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 ERG29YMR134W 714 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 AAH1YNL141W 1044 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 RCL1YOL010W 1104 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 ATG29YPL166W 642 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YBR292CYBR292C 372 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YMR102CYMR102C 2505 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 CUS1YMR240C 1311 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 UBX7YBR273C 1311 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 PCA1YBR295W 3651 nt5.41□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 RRP3YHR065C 1506 nt5.4□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 RRG1YDR065W 1098 nt5.4□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 CNL1YDR357C 369 nt5.4□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 CAB1YDR531W 1104 nt5.4□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 EBP2YKL172W 1284 nt5.4□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 RPP0YLR340W 939 nt5.4□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 RCE1YMR274C 948 nt5.4□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 TLG2YOL018C 1194 nt5.4□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YNG1YOR064C 660 nt5.4□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.4□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.4□□□□□ -1.54
CLF1Q12309 SWI3YJL176C 2478 nt5.4□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 HST1YOL068C 1512 nt5.39□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 YBR139WYBR139W 1527 nt5.39□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 GCN20YFR009W 2259 nt5.39□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 RPC53YDL150W 1269 nt5.39□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 MHF2YDL160C-A 243 nt5.39□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 AAD4YDL243C 990 nt5.39□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.39□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 URA4YLR420W 1095 nt5.39□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.39□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 GRS1YBR121C 2004 nt5.39□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 SAC1YKL212W 1872 nt5.39□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 TGL1YKL140W 1647 nt5.38□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 YGR125WYGR125W 3111 nt5.38□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 BDP1YNL039W 1785 nt5.38□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 PCT1YGR202C 1275 nt5.38□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 FMP33YJL161W 543 nt5.38□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 CPR6YLR216C 1116 nt5.38□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 CSI1YMR025W 888 nt5.38□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 LTO1YNL260C 597 nt5.38□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 DCI1YOR180C 816 nt5.38□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 ANT1YPR128C 987 nt5.38□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 RRP14YKL082C 1305 nt5.38□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 YGR266WYGR266W 2106 nt5.38□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 SED4YCR067C 3198 nt5.37□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 MKS1YNL076W 1755 nt5.37□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 TRM8YDL201W 861 nt5.37□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 ZRT1YGL255W 1131 nt5.37□□□□□ -1.55
CLF1Q12309 IMP3YHR148W 552 nt5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.7 ms