Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
LMOD3Q0VAK6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LMOD3Q0VAK6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LMOD3Q0VAK6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms