Protein–RNA interactions for Protein: Q0GE19

SLC10A7, Sodium/bile acid cotransporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A7Q0GE19 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC10A7Q0GE19 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A7Q0GE19 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms