Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCBP1Q09161 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms