Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACSM1Q08AH1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACSM1Q08AH1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACSM1Q08AH1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACSM1Q08AH1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACSM1Q08AH1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACSM1Q08AH1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACSM1Q08AH1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACSM1Q08AH1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACSM1Q08AH1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACSM1Q08AH1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACSM1Q08AH1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACSM1Q08AH1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACSM1Q08AH1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ACSM1Q08AH1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ACSM1Q08AH1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms