Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.64■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
GOLGA3Q08378 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
GOLGA3Q08378 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
GOLGA3Q08378 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.43
GOLGA3Q08378 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms