Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN3Q08043 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms