Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EXOSC9Q06265 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EXOSC9Q06265 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EXOSC9Q06265 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms