Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC25A11Q02978 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC25A11Q02978 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms