Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF8Q02556 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF8Q02556 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms