Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYP27A1Q02318 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYP27A1Q02318 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYP27A1Q02318 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms