Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CENPEQ02224 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms