Protein–RNA interactions for Protein: Q02086

SP2, Transcription factor Sp2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP2Q02086 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SP2Q02086 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP2Q02086 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SP2Q02086 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP2Q02086 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP2Q02086 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP2Q02086 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SP2Q02086 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SP2Q02086 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP2Q02086 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP2Q02086 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP2Q02086 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP2Q02086 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP2Q02086 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SP2Q02086 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP2Q02086 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP2Q02086 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP2Q02086 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP2Q02086 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP2Q02086 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP2Q02086 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP2Q02086 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP2Q02086 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP2Q02086 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP2Q02086 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SP2Q02086 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP2Q02086 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP2Q02086 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP2Q02086 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP2Q02086 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP2Q02086 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP2Q02086 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP2Q02086 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP2Q02086 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP2Q02086 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP2Q02086 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP2Q02086 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP2Q02086 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP2Q02086 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SP2Q02086 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP2Q02086 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP2Q02086 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP2Q02086 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP2Q02086 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SP2Q02086 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP2Q02086 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP2Q02086 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP2Q02086 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP2Q02086 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP2Q02086 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP2Q02086 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP2Q02086 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP2Q02086 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SP2Q02086 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP2Q02086 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP2Q02086 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SP2Q02086 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SP2Q02086 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP2Q02086 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP2Q02086 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP2Q02086 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP2Q02086 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP2Q02086 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP2Q02086 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP2Q02086 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP2Q02086 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP2Q02086 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP2Q02086 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms