Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MYBPC1Q00872 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MYBPC1Q00872 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms