Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKB2Q00653 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFKB2Q00653 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms