Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CLTCQ00610 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CLTCQ00610 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CLTCQ00610 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms