Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK17Q00537 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms