Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HTRA4P83105 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HTRA4P83105 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms