Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMF1P82094 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
TMF1P82094 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMF1P82094 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMF1P82094 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMF1P82094 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TMF1P82094 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMF1P82094 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMF1P82094 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMF1P82094 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMF1P82094 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TMF1P82094 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TMF1P82094 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TMF1P82094 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TMF1P82094 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TMF1P82094 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TMF1P82094 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
TMF1P82094 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TMF1P82094 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMF1P82094 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TMF1P82094 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TMF1P82094 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TMF1P82094 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TMF1P82094 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TMF1P82094 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TMF1P82094 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TMF1P82094 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TMF1P82094 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TMF1P82094 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TMF1P82094 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMF1P82094 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMF1P82094 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMF1P82094 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMF1P82094 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMF1P82094 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMF1P82094 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
TMF1P82094 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
TMF1P82094 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
TMF1P82094 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMF1P82094 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMF1P82094 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMF1P82094 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMF1P82094 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMF1P82094 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TMF1P82094 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMF1P82094 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMF1P82094 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMF1P82094 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMF1P82094 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMF1P82094 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMF1P82094 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TMF1P82094 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMF1P82094 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMF1P82094 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMF1P82094 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMF1P82094 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMF1P82094 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
TMF1P82094 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TMF1P82094 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMF1P82094 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMF1P82094 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMF1P82094 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMF1P82094 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMF1P82094 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TMF1P82094 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMF1P82094 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMF1P82094 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMF1P82094 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
TMF1P82094 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMF1P82094 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TMF1P82094 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TMF1P82094 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TMF1P82094 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TMF1P82094 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TMF1P82094 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TMF1P82094 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TMF1P82094 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMF1P82094 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMF1P82094 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMF1P82094 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMF1P82094 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TMF1P82094 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TMF1P82094 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMF1P82094 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMF1P82094 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMF1P82094 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMF1P82094 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMF1P82094 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMF1P82094 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMF1P82094 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TMF1P82094 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
TMF1P82094 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMF1P82094 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMF1P82094 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMF1P82094 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMF1P82094 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMF1P82094 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMF1P82094 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMF1P82094 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TMF1P82094 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms