Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFI35P80217 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFI35P80217 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFI35P80217 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFI35P80217 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFI35P80217 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFI35P80217 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFI35P80217 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFI35P80217 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFI35P80217 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFI35P80217 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFI35P80217 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFI35P80217 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFI35P80217 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFI35P80217 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFI35P80217 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFI35P80217 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFI35P80217 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFI35P80217 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFI35P80217 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFI35P80217 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFI35P80217 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFI35P80217 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFI35P80217 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
IFI35P80217 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFI35P80217 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFI35P80217 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFI35P80217 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFI35P80217 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFI35P80217 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFI35P80217 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFI35P80217 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFI35P80217 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFI35P80217 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFI35P80217 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFI35P80217 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFI35P80217 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFI35P80217 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFI35P80217 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFI35P80217 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFI35P80217 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFI35P80217 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFI35P80217 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFI35P80217 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IFI35P80217 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFI35P80217 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFI35P80217 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFI35P80217 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IFI35P80217 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IFI35P80217 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFI35P80217 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFI35P80217 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFI35P80217 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFI35P80217 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFI35P80217 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFI35P80217 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFI35P80217 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFI35P80217 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFI35P80217 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFI35P80217 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFI35P80217 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFI35P80217 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFI35P80217 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFI35P80217 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms