Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVK-24P63145 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVK-24P63145 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms