Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBX1P62877 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBX1P62877 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBX1P62877 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBX1P62877 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBX1P62877 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBX1P62877 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBX1P62877 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBX1P62877 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBX1P62877 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBX1P62877 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBX1P62877 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBX1P62877 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBX1P62877 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBX1P62877 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBX1P62877 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBX1P62877 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBX1P62877 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBX1P62877 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBX1P62877 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBX1P62877 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBX1P62877 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBX1P62877 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBX1P62877 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBX1P62877 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBX1P62877 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBX1P62877 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBX1P62877 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBX1P62877 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBX1P62877 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBX1P62877 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBX1P62877 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBX1P62877 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RBX1P62877 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBX1P62877 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBX1P62877 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBX1P62877 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBX1P62877 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBX1P62877 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBX1P62877 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBX1P62877 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBX1P62877 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBX1P62877 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBX1P62877 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBX1P62877 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBX1P62877 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBX1P62877 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBX1P62877 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBX1P62877 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBX1P62877 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBX1P62877 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBX1P62877 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBX1P62877 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RBX1P62877 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBX1P62877 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBX1P62877 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBX1P62877 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBX1P62877 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBX1P62877 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBX1P62877 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBX1P62877 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBX1P62877 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBX1P62877 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms