Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM3P62310 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM3P62310 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM3P62310 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM3P62310 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM3P62310 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM3P62310 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LSM3P62310 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM3P62310 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM3P62310 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM3P62310 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM3P62310 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM3P62310 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM3P62310 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM3P62310 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM3P62310 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LSM3P62310 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LSM3P62310 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LSM3P62310 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LSM3P62310 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LSM3P62310 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM3P62310 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM3P62310 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM3P62310 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM3P62310 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM3P62310 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM3P62310 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM3P62310 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM3P62310 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM3P62310 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM3P62310 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LSM3P62310 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM3P62310 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM3P62310 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM3P62310 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM3P62310 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM3P62310 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM3P62310 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM3P62310 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM3P62310 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM3P62310 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM3P62310 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM3P62310 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LSM3P62310 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM3P62310 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM3P62310 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM3P62310 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM3P62310 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM3P62310 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM3P62310 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM3P62310 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM3P62310 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM3P62310 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM3P62310 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM3P62310 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM3P62310 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM3P62310 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM3P62310 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LSM3P62310 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM3P62310 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM3P62310 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM3P62310 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM3P62310 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM3P62310 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM3P62310 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM3P62310 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM3P62310 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM3P62310 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM3P62310 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM3P62310 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM3P62310 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM3P62310 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM3P62310 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM3P62310 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM3P62310 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM3P62310 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM3P62310 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM3P62310 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM3P62310 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM3P62310 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms