Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
POLR2FP61218 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLR2FP61218 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLR2FP61218 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms