Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR3P61158 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTR3P61158 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTR3P61158 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTR3P61158 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTR3P61158 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTR3P61158 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3P61158 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3P61158 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3P61158 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3P61158 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3P61158 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3P61158 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3P61158 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3P61158 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3P61158 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3P61158 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3P61158 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3P61158 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3P61158 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3P61158 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3P61158 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3P61158 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3P61158 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3P61158 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3P61158 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3P61158 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3P61158 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3P61158 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3P61158 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3P61158 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3P61158 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3P61158 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3P61158 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3P61158 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3P61158 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3P61158 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3P61158 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3P61158 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3P61158 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3P61158 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3P61158 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3P61158 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3P61158 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3P61158 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3P61158 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3P61158 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTR3P61158 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3P61158 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3P61158 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3P61158 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3P61158 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3P61158 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3P61158 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3P61158 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3P61158 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3P61158 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3P61158 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3P61158 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3P61158 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3P61158 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3P61158 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTR3P61158 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3P61158 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3P61158 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3P61158 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3P61158 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3P61158 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTR3P61158 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms