Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EIF4A1P60842 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EIF4A1P60842 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms