Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTBP60709 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTBP60709 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTBP60709 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTBP60709 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTBP60709 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTBP60709 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTBP60709 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTBP60709 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTBP60709 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ACTBP60709 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTBP60709 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTBP60709 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTBP60709 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTBP60709 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTBP60709 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTBP60709 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTBP60709 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTBP60709 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTBP60709 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTBP60709 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTBP60709 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTBP60709 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTBP60709 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTBP60709 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTBP60709 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTBP60709 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTBP60709 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTBP60709 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTBP60709 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTBP60709 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTBP60709 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTBP60709 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTBP60709 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTBP60709 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTBP60709 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTBP60709 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTBP60709 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTBP60709 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTBP60709 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTBP60709 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTBP60709 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTBP60709 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTBP60709 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTBP60709 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTBP60709 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTBP60709 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTBP60709 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTBP60709 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTBP60709 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTBP60709 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTBP60709 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTBP60709 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTBP60709 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTBP60709 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTBP60709 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTBP60709 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTBP60709 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTBP60709 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTBP60709 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTBP60709 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTBP60709 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTBP60709 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTBP60709 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTBP60709 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTBP60709 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTBP60709 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTBP60709 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms