Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVPABLB-1P60509 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERVPABLB-1P60509 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms