Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB15P59190 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB15P59190 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB15P59190 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB15P59190 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB15P59190 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB15P59190 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB15P59190 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB15P59190 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB15P59190 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB15P59190 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB15P59190 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB15P59190 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB15P59190 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB15P59190 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB15P59190 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB15P59190 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB15P59190 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB15P59190 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB15P59190 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB15P59190 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB15P59190 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB15P59190 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB15P59190 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB15P59190 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB15P59190 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB15P59190 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB15P59190 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB15P59190 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB15P59190 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB15P59190 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB15P59190 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB15P59190 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB15P59190 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB15P59190 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB15P59190 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB15P59190 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB15P59190 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB15P59190 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB15P59190 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB15P59190 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB15P59190 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB15P59190 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB15P59190 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB15P59190 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB15P59190 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB15P59190 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB15P59190 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB15P59190 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB15P59190 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB15P59190 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB15P59190 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB15P59190 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB15P59190 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB15P59190 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB15P59190 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB15P59190 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB15P59190 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB15P59190 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB15P59190 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB15P59190 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB15P59190 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB15P59190 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB15P59190 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB15P59190 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB15P59190 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB15P59190 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB15P59190 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB15P59190 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB15P59190 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB15P59190 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB15P59190 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB15P59190 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB15P59190 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB15P59190 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB15P59190 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB15P59190 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB15P59190 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB15P59190 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB15P59190 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB15P59190 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB15P59190 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB15P59190 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms