Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF3P57682 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF3P57682 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF3P57682 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF3P57682 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF3P57682 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF3P57682 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF3P57682 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF3P57682 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF3P57682 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF3P57682 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF3P57682 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF3P57682 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF3P57682 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF3P57682 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF3P57682 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF3P57682 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF3P57682 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF3P57682 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF3P57682 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF3P57682 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF3P57682 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF3P57682 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF3P57682 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF3P57682 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF3P57682 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF3P57682 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF3P57682 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF3P57682 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF3P57682 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF3P57682 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF3P57682 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF3P57682 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF3P57682 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF3P57682 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF3P57682 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF3P57682 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF3P57682 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF3P57682 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF3P57682 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF3P57682 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF3P57682 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF3P57682 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF3P57682 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF3P57682 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLF3P57682 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLF3P57682 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF3P57682 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF3P57682 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF3P57682 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF3P57682 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF3P57682 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF3P57682 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF3P57682 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF3P57682 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF3P57682 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF3P57682 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF3P57682 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF3P57682 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF3P57682 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF3P57682 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF3P57682 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms