Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSWP56202 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSWP56202 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTSWP56202 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTSWP56202 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTSWP56202 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CTSWP56202 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTSWP56202 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTSWP56202 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTSWP56202 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTSWP56202 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTSWP56202 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTSWP56202 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CTSWP56202 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTSWP56202 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTSWP56202 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTSWP56202 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTSWP56202 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTSWP56202 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTSWP56202 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTSWP56202 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTSWP56202 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTSWP56202 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CTSWP56202 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTSWP56202 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTSWP56202 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTSWP56202 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTSWP56202 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTSWP56202 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTSWP56202 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTSWP56202 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTSWP56202 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTSWP56202 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTSWP56202 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTSWP56202 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTSWP56202 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTSWP56202 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTSWP56202 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTSWP56202 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTSWP56202 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTSWP56202 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTSWP56202 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTSWP56202 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTSWP56202 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTSWP56202 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTSWP56202 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTSWP56202 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTSWP56202 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTSWP56202 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTSWP56202 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTSWP56202 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTSWP56202 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTSWP56202 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CTSWP56202 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTSWP56202 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CTSWP56202 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTSWP56202 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTSWP56202 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTSWP56202 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTSWP56202 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTSWP56202 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTSWP56202 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTSWP56202 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTSWP56202 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTSWP56202 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTSWP56202 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTSWP56202 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTSWP56202 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CTSWP56202 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTSWP56202 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTSWP56202 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTSWP56202 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CTSWP56202 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTSWP56202 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CTSWP56202 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTSWP56202 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CTSWP56202 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTSWP56202 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTSWP56202 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CTSWP56202 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTSWP56202 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTSWP56202 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTSWP56202 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTSWP56202 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTSWP56202 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTSWP56202 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTSWP56202 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTSWP56202 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTSWP56202 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CTSWP56202 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTSWP56202 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTSWP56202 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTSWP56202 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTSWP56202 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTSWP56202 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTSWP56202 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTSWP56202 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTSWP56202 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTSWP56202 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTSWP56202 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms