Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF3BP55884 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3BP55884 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3BP55884 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms