Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ELLP55199 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ELLP55199 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ELLP55199 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELLP55199 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELLP55199 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELLP55199 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELLP55199 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELLP55199 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELLP55199 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELLP55199 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELLP55199 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELLP55199 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELLP55199 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELLP55199 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELLP55199 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELLP55199 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELLP55199 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELLP55199 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELLP55199 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELLP55199 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELLP55199 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELLP55199 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELLP55199 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELLP55199 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELLP55199 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELLP55199 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ELLP55199 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELLP55199 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELLP55199 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELLP55199 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELLP55199 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELLP55199 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELLP55199 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms