Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EPHB3P54753 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
EPHB3P54753 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB3P54753 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB3P54753 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB3P54753 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB3P54753 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB3P54753 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB3P54753 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB3P54753 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB3P54753 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB3P54753 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB3P54753 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB3P54753 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB3P54753 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB3P54753 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EPHB3P54753 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms