Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RAD23AP54725 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms