Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP1B3P54709 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATP1B3P54709 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms