Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATN1P54259 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATN1P54259 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATN1P54259 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATN1P54259 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATN1P54259 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATN1P54259 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATN1P54259 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATN1P54259 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATN1P54259 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATN1P54259 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATN1P54259 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATN1P54259 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATN1P54259 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATN1P54259 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATN1P54259 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATN1P54259 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATN1P54259 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATN1P54259 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATN1P54259 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATN1P54259 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATN1P54259 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATN1P54259 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATN1P54259 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATN1P54259 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATN1P54259 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATN1P54259 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATN1P54259 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATN1P54259 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATN1P54259 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATN1P54259 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATN1P54259 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATN1P54259 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATN1P54259 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATN1P54259 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATN1P54259 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATN1P54259 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATN1P54259 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATN1P54259 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATN1P54259 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATN1P54259 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATN1P54259 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATN1P54259 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATN1P54259 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATN1P54259 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATN1P54259 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATN1P54259 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATN1P54259 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATN1P54259 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATN1P54259 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATN1P54259 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATN1P54259 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATN1P54259 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATN1P54259 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATN1P54259 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATN1P54259 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATN1P54259 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATN1P54259 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATN1P54259 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATN1P54259 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATN1P54259 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATN1P54259 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATN1P54259 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATN1P54259 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATN1P54259 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATN1P54259 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATN1P54259 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATN1P54259 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATN1P54259 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATN1P54259 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATN1P54259 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATN1P54259 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATN1P54259 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATN1P54259 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATN1P54259 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATN1P54259 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATN1P54259 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATN1P54259 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATN1P54259 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATN1P54259 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATN1P54259 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATN1P54259 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATN1P54259 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATN1P54259 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATN1P54259 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATN1P54259 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATN1P54259 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATN1P54259 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATN1P54259 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATN1P54259 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATN1P54259 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATN1P54259 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATN1P54259 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATN1P54259 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATN1P54259 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATN1P54259 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATN1P54259 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATN1P54259 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATN1P54259 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATN1P54259 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms