Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC5A3P53794 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A3P53794 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms