Protein–RNA interactions for Protein: P53634

CTSC, Dipeptidyl peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSCP53634 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSCP53634 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTSCP53634 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSCP53634 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSCP53634 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSCP53634 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSCP53634 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSCP53634 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSCP53634 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSCP53634 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSCP53634 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSCP53634 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTSCP53634 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSCP53634 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSCP53634 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSCP53634 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSCP53634 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSCP53634 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSCP53634 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSCP53634 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSCP53634 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSCP53634 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSCP53634 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSCP53634 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSCP53634 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSCP53634 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTSCP53634 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSCP53634 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSCP53634 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSCP53634 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSCP53634 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSCP53634 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSCP53634 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSCP53634 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSCP53634 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSCP53634 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSCP53634 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSCP53634 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSCP53634 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSCP53634 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSCP53634 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSCP53634 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSCP53634 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSCP53634 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSCP53634 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSCP53634 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSCP53634 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSCP53634 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSCP53634 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSCP53634 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSCP53634 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSCP53634 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSCP53634 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSCP53634 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSCP53634 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSCP53634 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSCP53634 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSCP53634 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSCP53634 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSCP53634 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSCP53634 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSCP53634 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSCP53634 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSCP53634 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSCP53634 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSCP53634 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSCP53634 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTSCP53634 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTSCP53634 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSCP53634 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSCP53634 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSCP53634 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTSCP53634 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSCP53634 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSCP53634 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSCP53634 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSCP53634 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSCP53634 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSCP53634 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSCP53634 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSCP53634 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSCP53634 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSCP53634 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSCP53634 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms