Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF140P52738 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF140P52738 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms