Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGDP52209 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PGDP52209 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGDP52209 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGDP52209 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PGDP52209 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGDP52209 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGDP52209 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGDP52209 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGDP52209 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGDP52209 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGDP52209 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGDP52209 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGDP52209 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PGDP52209 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGDP52209 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGDP52209 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGDP52209 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGDP52209 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGDP52209 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGDP52209 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGDP52209 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PGDP52209 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGDP52209 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGDP52209 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PGDP52209 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGDP52209 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGDP52209 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGDP52209 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGDP52209 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PGDP52209 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGDP52209 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PGDP52209 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PGDP52209 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGDP52209 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGDP52209 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGDP52209 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGDP52209 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGDP52209 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGDP52209 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGDP52209 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGDP52209 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PGDP52209 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGDP52209 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGDP52209 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PGDP52209 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PGDP52209 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PGDP52209 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PGDP52209 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGDP52209 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGDP52209 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PGDP52209 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PGDP52209 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGDP52209 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGDP52209 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGDP52209 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGDP52209 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PGDP52209 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PGDP52209 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGDP52209 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGDP52209 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGDP52209 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGDP52209 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGDP52209 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGDP52209 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGDP52209 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGDP52209 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGDP52209 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PGDP52209 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PGDP52209 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGDP52209 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGDP52209 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGDP52209 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PGDP52209 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGDP52209 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGDP52209 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGDP52209 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGDP52209 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGDP52209 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGDP52209 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms