Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE2E1P51965 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2E1P51965 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms